哈佛大学开发可同时测试数百万个基因的技术

哈佛大学Wis研究所的一个研究小组开发了一种新的基因编辑工具，该工具可以同时运行数百万个基因实验。使用称为Retron Library Recombineering（RLR）的技术来操纵细菌DNA片段，称为Retron，该片段可产生单链DNA片段。

在基因编辑方面，CRISPR-Cas9技术在过去几年中一直是热门话题。它主要用于疾病治疗的研究，因为它可以比现有技术更轻松地更精确地排列DNA序列。然而，CRISPR技术切割了一部分DNA，目的是将突变序列整合到基因组中。此时，Cas9酶可能在分子水平上经常切割除靶标以外的位置，这在细胞水平上似乎是有害的。

相反，Retron可以将DNA的突变链引入正在复制的细胞中，并用其填充子细胞。填充的数组在每次拆分时都会重复，并且数组本身充当条形码，用于标识哪个实体接收了每个回溯数组。这样可以更轻松地跟踪已正确创建的突变体。这种方法允许基因组编辑一次运行多个实验，并放置大量序列而不会损坏原始DNA。

研究人员在大肠杆菌中对RLR进行了测试，并进行了一些调整，以确认90％的个体能够整合Retron阵列。在该实验中，通过查找Retron条码的碱基序列，可以大大缩短发现大肠杆菌抗药性突变的过程，而不是寻找单个的突变碱基序列。

研究人员向RLR迈进了一步，研究了该技术是否可以应用于随机片段化的DNA以及可以再次使用的逆转录数量。他们切割了对其他抗生素具有抗性的大肠杆菌基因组，并利用该片段建立了DNA分子逆转录序列中包含的数千万个基因的文库，以及分配给子细胞的染色体（称为质粒）。

研究小组说，现在有可能研究全基因组突变的影响以及这些突变如何相互作用。该研究还表明，RLR将帮助建立在其他遗传系统中使用的路线图，并将为未来的遗传研究提供令人兴奋的可能性。相关信息可以在这里找到。