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DeepMind 开源蛋白质结构分析算法

谷歌旗下人工智能公司DeepMind宣布开源其研发已久的蛋白质三维结构预测分析算法AlphaFold,并将源代码免费发布到GitHub。 DeepMind 将 AlphaFold 开源,表明用户可以以前所未有的精度解开蛋白质的三维结构。

它是一种高分子化合物,结合了从核苷酸信息基因组中解码的20种氨基酸,构成了在人体内执行各种功能的蛋白质基因。然而,从碱基信息中只能知道氨基酸连接的一级序列信息。要分析蛋白质在体内的工作原理,必须了解蛋白质的三维结构。然而,仅从氨基酸序列信息不能知道三维结构。如何阐明这种蛋白质的构象的问题正在研究蛋白质折叠。

三维结构解析本身已经在进行中,过去通过核磁共振、低温电子显微镜、X射线衍射等方法来鉴定蛋白质的三维结构,但没有人有过。除非是研究团队和医疗机构的高预算和高成本,否则这是一个难题。另外,从数据中阐明实际的三维结构需要大量的计算能力,而且需要分析超级计算机和Folding@home等分布式计算操作,因此不仅有金钱成本,还有时间成本。

DeepMind 于 2018 年开发的 Alpha Fold 是一种利用机器学习从基因序列信息中预测蛋白质三维结构的技术。因此,可以在不产生与以前相同的成本的情况下阐明蛋白质的三维结构。事实上,据报道,在蛋白质结构预测大赛中对Alpha Fold的评价超过了其他计算机程序。

此外,2021 年 7 月 16 日,DeepMind 联合创始人兼首席执行官 Demis Hassabis 宣布 Alphafold 2.0 版将开源,并将源代码发布在 GitHub 上。与此同时,一篇关于Alphafold的论文发表在《自然》杂志上。关于AlphaFold开源,DeepMind的母公司Google CEO Sundar Pichai表示,他很高兴DeepMind AlphaFold技术与开源代码一起发布。说。相关信息可以在这里找到。

lswcap

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通过每月的AHC PC和HowPC杂志时代,他在网络IT媒体上观看了“技术时代”,如ZDNet,电子报互联网经理,Consumer Journal Ivers的编辑,TechHolic出版商和Venture Square的编辑。 我很好奇这个仍然充满活力的市场。

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